Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHADO15335 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHADO15335 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHADO15335 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHADO15335 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHADO15335 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHADO15335 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHADO15335 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHADO15335 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHADO15335 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHADO15335 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHADO15335 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHADO15335 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHADO15335 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHADO15335 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHADO15335 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHADO15335 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHADO15335 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHADO15335 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHADO15335 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHADO15335 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHADO15335 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHADO15335 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHADO15335 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHADO15335 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHADO15335 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHADO15335 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHADO15335 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHADO15335 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHADO15335 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHADO15335 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHADO15335 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHADO15335 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHADO15335 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHADO15335 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHADO15335 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHADO15335 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHADO15335 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHADO15335 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHADO15335 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHADO15335 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHADO15335 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHADO15335 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHADO15335 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHADO15335 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHADO15335 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHADO15335 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHADO15335 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHADO15335 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHADO15335 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHADO15335 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHADO15335 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHADO15335 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHADO15335 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHADO15335 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHADO15335 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHADO15335 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHADO15335 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHADO15335 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHADO15335 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHADO15335 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHADO15335 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHADO15335 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHADO15335 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHADO15335 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHADO15335 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHADO15335 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHADO15335 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHADO15335 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHADO15335 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHADO15335 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHADO15335 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHADO15335 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHADO15335 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHADO15335 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHADO15335 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHADO15335 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHADO15335 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHADO15335 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHADO15335 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHADO15335 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHADO15335 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHADO15335 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHADO15335 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHADO15335 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHADO15335 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHADO15335 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHADO15335 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHADO15335 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHADO15335 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHADO15335 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHADO15335 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHADO15335 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHADO15335 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHADO15335 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHADO15335 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHADO15335 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHADO15335 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHADO15335 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHADO15335 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms