Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAMP3O14828 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAMP3O14828 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAMP3O14828 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms