Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KPNA3O00505 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KPNA3O00505 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KPNA3O00505 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KPNA3O00505 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms