Protein–RNA interactions for Protein: O00186

STXBP3, Syntaxin-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STXBP3O00186 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STXBP3O00186 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
STXBP3O00186 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STXBP3O00186 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STXBP3O00186 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
STXBP3O00186 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms