Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNAP23O00161 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SNAP23O00161 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SNAP23O00161 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms