Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMIM22K7EJ46 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMIM22K7EJ46 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMIM22K7EJ46 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms