Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
I3L4J1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
I3L4J1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
I3L4J1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
I3L4J1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
I3L4J1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
I3L4J1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
I3L4J1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
I3L4J1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
I3L4J1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
I3L4J1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
I3L4J1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
I3L4J1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
I3L4J1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
I3L4J1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
I3L4J1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
I3L4J1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
I3L4J1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
I3L4J1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
I3L4J1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
I3L4J1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
I3L4J1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
I3L4J1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
I3L4J1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
I3L4J1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
I3L4J1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
I3L4J1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
I3L4J1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
I3L4J1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
I3L4J1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
I3L4J1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
I3L4J1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
I3L4J1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
I3L4J1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
I3L4J1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
I3L4J1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
I3L4J1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
I3L4J1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
I3L4J1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
I3L4J1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
I3L4J1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
I3L4J1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
I3L4J1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
I3L4J1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
I3L4J1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
I3L4J1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
I3L4J1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
I3L4J1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
I3L4J1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
I3L4J1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
I3L4J1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
I3L4J1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
I3L4J1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
I3L4J1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
I3L4J1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
I3L4J1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
I3L4J1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
I3L4J1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
I3L4J1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
I3L4J1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
I3L4J1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
I3L4J1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
I3L4J1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
I3L4J1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
I3L4J1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
I3L4J1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
I3L4J1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
I3L4J1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
I3L4J1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
I3L4J1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
I3L4J1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
I3L4J1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
I3L4J1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
I3L4J1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
I3L4J1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
I3L4J1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
I3L4J1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
I3L4J1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
I3L4J1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
I3L4J1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
I3L4J1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
I3L4J1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
I3L4J1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
I3L4J1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
I3L4J1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
I3L4J1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
I3L4J1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
I3L4J1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
I3L4J1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
I3L4J1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
I3L4J1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
I3L4J1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
I3L4J1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
I3L4J1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
I3L4J1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
I3L4J1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
I3L4J1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
I3L4J1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
I3L4J1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
I3L4J1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms