Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CFAP99D6REC4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP99D6REC4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP99D6REC4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms