Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DIRC3C9JPN6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DIRC3C9JPN6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DIRC3C9JPN6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms