Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN25C9JDP6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN25C9JDP6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN25C9JDP6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms