Protein–RNA interactions for Protein: C9J4A7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9J4A7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9J4A7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9J4A7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9J4A7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C9J4A7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C9J4A7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9J4A7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9J4A7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9J4A7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9J4A7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9J4A7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9J4A7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9J4A7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9J4A7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9J4A7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C9J4A7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9J4A7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9J4A7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9J4A7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9J4A7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9J4A7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9J4A7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9J4A7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9J4A7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9J4A7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9J4A7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9J4A7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9J4A7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9J4A7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9J4A7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9J4A7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C9J4A7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9J4A7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9J4A7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9J4A7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9J4A7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9J4A7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9J4A7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9J4A7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9J4A7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C9J4A7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9J4A7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9J4A7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9J4A7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9J4A7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9J4A7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9J4A7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9J4A7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9J4A7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9J4A7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9J4A7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9J4A7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9J4A7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9J4A7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9J4A7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9J4A7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9J4A7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9J4A7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9J4A7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9J4A7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9J4A7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9J4A7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9J4A7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C9J4A7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9J4A7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9J4A7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9J4A7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9J4A7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9J4A7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9J4A7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9J4A7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9J4A7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C9J4A7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9J4A7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9J4A7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9J4A7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C9J4A7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9J4A7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9J4A7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9J4A7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9J4A7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C9J4A7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9J4A7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9J4A7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9J4A7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
C9J4A7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C9J4A7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9J4A7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9J4A7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9J4A7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9J4A7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9J4A7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9J4A7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9J4A7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9J4A7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9J4A7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9J4A7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9J4A7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9J4A7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9J4A7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms