Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF839A8K0R7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF839A8K0R7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms