Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A6NNZ2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A6NNZ2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A6NNZ2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A6NNZ2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
A6NNZ2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A6NNZ2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A6NNZ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A6NNZ2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A6NNZ2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A6NNZ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A6NNZ2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A6NNZ2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A6NNZ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A6NNZ2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A6NNZ2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A6NNZ2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A6NNZ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A6NNZ2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A6NNZ2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A6NNZ2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
A6NNZ2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A6NNZ2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A6NNZ2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
A6NNZ2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A6NNZ2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A6NNZ2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A6NNZ2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A6NNZ2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NNZ2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NNZ2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NNZ2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NNZ2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NNZ2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NNZ2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NNZ2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NNZ2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NNZ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
A6NNZ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A6NNZ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A6NNZ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A6NNZ2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A6NNZ2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A6NNZ2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
A6NNZ2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
A6NNZ2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A6NNZ2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A6NNZ2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A6NNZ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A6NNZ2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
A6NNZ2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A6NNZ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A6NNZ2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
A6NNZ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A6NNZ2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A6NNZ2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A6NNZ2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A6NNZ2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A6NNZ2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A6NNZ2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
A6NNZ2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
A6NNZ2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A6NNZ2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
A6NNZ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A6NNZ2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A6NNZ2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A6NNZ2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A6NNZ2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
A6NNZ2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A6NNZ2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
A6NNZ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A6NNZ2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A6NNZ2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A6NNZ2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A6NNZ2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A6NNZ2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A6NNZ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A6NNZ2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A6NNZ2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A6NNZ2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A6NNZ2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A6NNZ2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A6NNZ2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
A6NNZ2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A6NNZ2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
A6NNZ2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A6NNZ2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A6NNZ2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A6NNZ2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A6NNZ2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A6NNZ2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A6NNZ2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A6NNZ2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A6NNZ2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A6NNZ2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A6NNZ2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A6NNZ2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A6NNZ2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A6NNZ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A6NNZ2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms