Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM247A6NEH6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM247A6NEH6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM247A6NEH6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms