Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00862A6NCI5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00862A6NCI5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms