Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SSPOA2VEC9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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