Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQU0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQU0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A1W2PQU0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A1W2PQU0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQU0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A1W2PQU0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms