Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MAP3K4Q9Y6R4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms