Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HDGFL3Q9Y3E1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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HDGFL3Q9Y3E1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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HDGFL3Q9Y3E1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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HDGFL3Q9Y3E1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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HDGFL3Q9Y3E1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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HDGFL3Q9Y3E1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HDGFL3Q9Y3E1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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