Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED16Q9Y2X0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms