Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NEU3Q9UQ49 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms