Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms