Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BRPF3Q9ULD4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BRPF3Q9ULD4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms