Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
C6orf48Q9UBA6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms