Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LMBRD1Q9NUN5 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms