Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TREX1Q9NSU2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms