Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CYLDQ9NQC7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYLDQ9NQC7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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