Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX9Q9NQ69 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX9Q9NQ69 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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