Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A4GALTQ9NPC4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A4GALTQ9NPC4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms