Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM38AQ9H6F2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM38AQ9H6F2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms