Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00597Q9H2U6 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00597Q9H2U6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms