Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA4CQ9C0C4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms