Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM5DQ9BY66 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms