Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TDRD1Q9BXT4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TDRD1Q9BXT4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms