Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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IFT27Q9BW83 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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IFT27Q9BW83 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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IFT27Q9BW83 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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IFT27Q9BW83 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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IFT27Q9BW83 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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IFT27Q9BW83 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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IFT27Q9BW83 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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IFT27Q9BW83 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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IFT27Q9BW83 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFT27Q9BW83 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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