Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHOXF2Q9BQY4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOXF2Q9BQY4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms