Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP8Q99708 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms