Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP88Q99567 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP88Q99567 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms