Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SIN3AQ96ST3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SIN3AQ96ST3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms