Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NSMCE2Q96MF7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms