Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMD3Q96D46 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms