Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
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PTPRUQ92729 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPRUQ92729 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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PTPRUQ92729 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRUQ92729 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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