Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms