Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SVOPQ8N4V2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms