Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZBED9Q6R2W3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZBED9Q6R2W3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
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