Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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H3F3CQ6NXT2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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H3F3CQ6NXT2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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H3F3CQ6NXT2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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H3F3CQ6NXT2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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H3F3CQ6NXT2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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H3F3CQ6NXT2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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H3F3CQ6NXT2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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H3F3CQ6NXT2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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H3F3CQ6NXT2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H3F3CQ6NXT2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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