Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UPP1Q16831 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms