Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FXNQ16595 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FXNQ16595 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FXNQ16595 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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FXNQ16595 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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FXNQ16595 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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FXNQ16595 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FXNQ16595 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FXNQ16595 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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FXNQ16595 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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FXNQ16595 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FXNQ16595 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FXNQ16595 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FXNQ16595 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FXNQ16595 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FXNQ16595 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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