Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SGCBQ16585 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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