Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC37Q16543 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC37Q16543 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms